Studoval na Janáčkově konzervatoři obory dirigování a klarinet. Absolvoval dvojí  magisterská studia, nejprve na Fakultě umění Ostravské univerzity, obor hra na  klarinet (2012) a poté na Janáčkově akademii múzických umění v Brně, obor dirigování orchestru ve třídě mezinárodně uznávaného dirigenta Tomáše Hanuse (2017). Nyní je na JAMU posluchačem v doktorského studijního programu.  V roce 2015 mu bylo uděleno Stipendium Bayreuther Festspiele.

Marek Prášil je v angažmá Národního divadla moravskoslezského. V současnosti zde diriguje více než 10 titulů operního, baletního i muzikálového repertoáru, mj. Smetanovy Branibory v Čechách, Čajkovského Labutí jezero, Lloyd Webberovy muzikály Jesus Christ Superstar, Evita, Josef a jeho úžasný pestrobarevný plášť, muzikál Rebecca a mnoho dalších. V minulosti to byly kupříkladu Donizettiho Marie Stuartovna, Smetanova Čertova stěna, Martinů balet Škrtič, Straussova opereta Noc v Benátkách, muzikály Sunset boulevard, Funny girl, Fantom Londýna, Mrazík a Quo Vadis. Mezi nejúspěšnější inscenace, které hudebně nastudoval patří muzikál Edith a Marlene či balet Carmina Burana. S posledně jmenovaným titulem debutoval v roce 2016 na Mezinárodním hudebním festivalu Smetanova Litomyšl.

Marek Prášil doposud spolupracoval s PKF – Prague Philharmonia, Janáčkovou filharmonií Ostrava, Plzeňskou filharmonií, Filharmonií Brno, Moravskou filharmonií Olomouc, Filharmonií Bohuslava Martinů Zlín, Jihočeskou filharmonií, Komorní filharmonií Pardubice atd. V srpnu 2016 debutoval dvěma koncerty ve Švýcarsku u Sinfonie Orchester Biel Solothurn. Dirigentská hostování zahrnují také mimo jiné mezinárodní hudební festivaly Janáčkův Máj, Smetanova Litomyšl, Mladé pódium, Svatováclavský hudební festival, Talentinum Zlín či Złota Lira v Polsku.

Na divadelních prknech hostoval Marek Prášil ve Státním divadle Košice (Belliniho Náměsíčná), na podzim 2014 působil jako asistent dirigenta při nastudování Janáčkovy opery Věc Makropulos v Bayerische Staatsoper v Mnichově, ve stejné pozici působil také na jaře 2017 ve Welsh National Opera v Cardiffu u nového nastudování Straussova Rosenkavaliera. Do Bayerische Staatsoper v Mnichově se opět vrátí v roce 2018 jako asistent nového nastudování Smetanovy Prodané nevěsty. V červenci 2015 vystoupil s muzikálovým souborem NDM na Mezinárodním festivalu DIMF v jihokorejském Daegu. Inscenace Fantoma Londýna zde získala hlavní cenu festivalu. Pro Slezské divadlo Opava připravil hudební nastudování Kálmánovy operety Hraběnka Marica.

V letech 2007–2013 byl Marek Prášil dirigentem Symfonického dechového orchestru Májovák, se kterým kromě mnoha ocenění na soutěžích a festivalech v Česku i zahraničí (mimo jiné také dvě ocenění za nejlepší dirigentský výkon na mezinárodních soutěžích v Ostravě a polském Rybniku) podnikl turné do Francie, Itálie, Rakouska, Norska či na Sicílii. V červnu 2013 se s orchestrem rozloučil provedením české premiéry kompletní transkripce kantáty Carmina Burana, ve spolupráci s operním sborem NDM a Pěveckým studiem Permoník. V roce 2013 nahrál CD pro německé vydavatelství Halter s Moravským dechovým orchestrem (dřívější Ústřední hudbou Ministerstva vnitra ČR), v roce 2016 pak s Hanou Fialovou a orchestrem operety/muzikálu NDM natočil historicky první profesionální nahrávku tohoto souboru – CD Hana/Edith s nejznámějšími šansony Edith Piaf, v roce 2018 natočil CD Martina Chodúra s Janáčkovou filharmonií Ostrava.

Marek Prášil je zastupován agenturou Janáčkův máj, o. p. s.